Tras tres temporadas, en 1949, la liga se fusionó con la National Basketball League fundada en 1937 para formar la National Basketball Association (NBA). Tres veces durante la temporada, Lin fue asignado al equipo afiliado a los Warriors en la Liga de Desarrollo de la NBA, los Reno Bighorns. Lin se recuperó de una lesión en el tendón rotuliano de la rodilla izquierda durante el cierre patronal de la NBA. Lin en una situación incorrecta. Pese a que Wall recibió la mayor ovación en las presentaciones de los jugadores, los angeles clippers camiseta el público cambió de bando y acabó alentando a Lin para el final del juego. «Cuando juego de visitante, no siento que el reflector esté sobre mí», admitió Lin. El San Jose Mercury News escribió que Lin «tenía algo de figura de culto» después de ser fichado. El Área de la Bahía de San Francisco, con su gran población asiática americana, celebraba su llegada. Apreciaba el apoyo, especialmente el de la comunidad asiática americana, pero prefería centrarse en su juego más aún cuando todavía no «había demostrado nada a nadie». Lin sentía al principio que no era lo demasiado bueno para jugar en la NBA, pero más tarde se dio cuenta de que estaba aprendiendo y obteniendo más minutos de juego en la Liga de Desarrollo que no habría recibido con los Warriors.
Los dirigentes del equipo a menudo denegaron peticiones para Lin con el fin de ayudar a mantenerlo concentrado. Dos puntos: si el balón es encestado desde el interior del área delimitada por la línea de tres puntos, cerca del aro. Smart vio que Lin tenía habilidad para llegar a la zona pintada pero que necesitaba aprender a pasar el balón porque, a su entender, Lin «no podía lanzar al aro para nada». Lin ayudó a los Bighorns a conseguir un récord de 2-0 en la exhibición con promedios de 21,5 puntos, 6,0 rebotes, 5,5 asistencias y 3,5 robos. En veinte juegos con los Bighorns promedió 18 puntos, 5,8 rebotes y 4,4 asistencias. Lin terminó su temporada de rookie en la NBA promediando 2,6 puntos con un 38,9% en tiros de campo en veintinueve juegos. Lin anotó 13 puntos frente a los 21 de Wall, pero lo hizo con un 6 de 12 (50%) en lanzamientos de campo en 28 minutos frente a los 4 de 19 (21%) de Wall en 33 minutos. El contrato de Lin era parcialmente garantizado para la temporada 2010-11, y los Warriors mantenían una opción de equipo para la segunda temporada.
Lin también firmó un contrato garantizado por tres años con Nike. Lin comentó que las contraofertas de los otros tres equipos eran más altas, pero él quería jugar para los Warriors. Los Warriors organizaron una conferencia de prensa para Lin tras su fichaje, camiseta charlotte hornets con la presencia de medios nacionales. Más de veinte miembros de la prensa china de Toronto cubrieron el juego. En el partido de exhibición que abría la temporada en el Oracle Arena de los Warriors, Lin recibió la ovación más ruidosa de la noche cuando entró al juego en el cuarto cuarto. «Ninguno de los dos es un gran atleta, pero ambos somos efectivos y sabemos cómo jugar», señaló Lin. El jugador continuó mejorando su pick and roll, cómo manejarse ante jugadas defensivas como la doble marca o las trampas, y mejoró su técnica de tiro, especialmente su lanzamiento de tres puntos. En una derrota de visitante ante los Lakers por 89-117, Lin anotó su mejor marca personal de su carrera (de ese entonces) con 13 puntos en 18 minutos tras haber anotado solo 7 en total en sus primeros seis juegos. Aunque solamente contra los dos equipos de dichas divisiones que hayan terminado en la misma posición que él en la temporada anterior (2 partidos, uno de ellos en casa y el otro fuera), haciendo un total de 12 partidos de conferencia.
Los equipos de la NBA varían en su capacidad para atraer patrocinios. El jugador explicó que como aún tenía contrato con los Golden State Warriors, no podría jugar en la CBA ya que esta liga solo admitía a jugadores de la NBA sin contrato. Yao Ming, estrella retirada de la NBA y presidente de los Shanghai Sharks, intentó sin éxito fichar a Lin para la siguiente temporada de la CBA. En septiembre de 2011, jugó algunos partidos vistiendo la camiseta de los Dongguan Leopards de la Chinese Basketball Association (CBA) en el ABA Club Championship, un torneo entre clubes del baloncesto asiático en el cual terminó siendo elegido MVP (jugador más valioso). Antes de cinco segundos, cada jugador con posesión de balón tiene que dar un pase, tirar a canasta o botar. La canasta debe estar ubicada a 3,05 m del suelo y su aro debe estar hecho en acero y unido a la red por doce puntos. Lin trabajó en su tiro a canasta durante la pretemporada y abandonó la forma de tiro que llevaba usando desde octavo grado.